Místo posledního odpočinku Jana Blažeje Santiniho mělo po zrušení kostela a hřbitova v roce 1782 zajímavé osudy. V roce 1792 byl kostel odkoupen Josefem Peznachem, který jej přeměnil na obytný dům. Tato změna se dotkla také okolního hřbitova, který měl být byl vyklizen. Ale je zajímavé, že prakticky současník prodeje kostela a autor pražského místopisu Jaroslav Schaller se o vyklizení nezmiňuje.

Jediné místo, kam mohly být v té době vyzvednuté ostatky převezeny byl tzv. Malostranský hřbitov v Košířích. Ten byl již v roce 1786 ustanoven jako oficiální hřbitov pro Malou Stranu, resp. pro tehdejší levobřežní část Prahy.

Velmi zajímavé informace přinesl archeologický průzkum Martina Omelky provedený v letech 2002 a 2004.

Ve stručnosti je možno jeho zjištění shrnout do těchto bodů:

• Průzkum se týkal cca poloviny původního pozemku hřbitova, část je dosud pod plochou parkoviště.
• Doloženo je vyklizení krypty a vykopání hřbitova, ovšem pouze cca do hloubky 2 metrů, tedy pouze nejvyšší vrstva hrobů.
• Níže byla objevena barokní fáze hřbitova, čítající více než 900 zemřelých, hřbitov byl tedy využíván intenzivně. 

Kde se tedy ocitly ostatky Jana Blažeje Santiniho a jeho rodiny?

• V tuto chvíli není doloženo přesnější umístění hrobu, či hrobového místa Santiniho, či jeho rodiny.
• Santini zemřel v prosinci 1723 a hřbitov byl využíván intenzivně téměř 60 let po jeho smrti, je pravděpodobné, že se jeho ostatky nacházely hlouběji než ve vyklizené vrchní vrstvě.
• Plocha hřbitova byla v letech 2002 a 2004 prozkoumána přibližně z poloviny.
• Je tedy možné, že se Santiniho tělesné ostatky dosud nacházejí tam, kde si on sám přál očekávat slavné vzkříšení, nelze to však nijak potvrdit či vyvrátit.

Článek Martina Omelky a další texty k lokalitě lze nalézt a podrobně prostudovat v násleujících odkazech:

• Omelka Martin, Hřbitov u kostela sv. Jana v Oboře ve Šporkově ulici čp. 322/III na Malé Straně v Praze, in: Staletá Praha, ročník XXV / 2009 č. 2, str. 93 - 101
• Šporkova ulice 1996 - 2005  [PDF; 6,21 MB]
• Bývalý kostel sv. Jana Křtitele v Oboře (Prtha archeologická)

Dobové informace o kostele:

• Josef František Jaroslav Schaller,
  Beschreibung der königlichen Haupt und Residenzstadt Prag sammt allen darinn befindlichen sehenswürdigen Merkwürdigkeiten, Die Kleinseite, oder das III. Hauptviertel der Stadt Prag, 2. díl, Praha 1795, str. 90  text zde